CEMED - strona startowa
zapisz się | wypisz się
O NASSPOTKANIA EDUKACYJNEWSPÓŁPRACABIURO PRASOWENEWSLETTERKONTAKT polski | English 07.09.2010
Koordynator organizacyjny: Marta Domańska

 

ZAPRASZAMY:
biologów molekularnych, biotechnologów i diagnostów laboratoryjnych (z zakresu genetyki medycznej i poradnictwa genetycznego)

 

Planowana ilość osób: 12-16

 

Reakcja łańcuchowa polimerazy DNA z analizą ilości produktu w czasie rzeczywistym (ang. real-time PCR) to jedna z najnowocześniejszych metod analitycznych mających zastosowanie w genetyce, biologii molekularnej, mikrobiologii, wirusologii, onkologii, diagnostyce medycznej i innych pokrewnych dziedzinach. Wykorzystanie sond fluorescencyjnych pozwala nie tylko na monitorowanie przyrostu ilości produktu amplifikacji w każdym cyklu prowadzonej reakcji PCR, a także jego ocenę jakościową. Realt-time PCR umożliwia oznaczanie ilości kwasów nukleinowych w materiale badanym oraz wykrywania nawet niewielkich zmian w obrębie amplifikowanych sekwencji, dzięki czemu technika ta jest niezwykle cennym narzędziem znajdującym zastosowanie zarówno w badaniach naukowych jak i w diagnostyce molekularnej. Mamy nadzieję, że warsztaty nie tylko przybliżą Państwu tą technikę, ale również ułatwią podjęcie decyzji odnośnie ewentualnego wyboru i kupna platformy, która spełni Państwa oczekiwania i będzie odpowiednia dla Państwa zamierzeń naukowych.

 

Prowadzący:

  • dr Marcin Hołysz  notka», Katedra i Zakład Biochemii i Biologii Molekularnej, Uniwersytet Medyczny w Poznaniu
  • dr Błażej Rubiś  notka», Katedra i Zakład Chemii Klinicznej i Diagnostyki Molekularnej

 

Umiejętności jakie muszą posiadać uczestnicy warsztatów przed przystąpieniem do zajęć:

  • elementarne zasady pracy w laboratorium (praca jałowa, obsługa pipet automatycznych)
  • przydatna będzie znajomość podstaw PCR
  • z warsztatów skorzystają również osoby, które zetknęły się już z technologią real-time PCR (wartością będzie możliwość konsultacji trudniejszych przypadków z doświadczonymi użytkownikami różnych platform sprzętowych)

 

Umiejętności jakie nabędą uczestnicy warsztatów:

  • dobór i zakup sprzętu do prowadzenia reakcji Real-time PCR
  • projektowanie eksperymentów – projektowanie starterów i sond do oznaczeń ilościowych i jakościowych techniką real-time PCR
  • przeprowadzanie oznaczeń ilościowych (kwantyfikacja względna i bezwzględna)
  • przeprowadzanie oznaczeń jakościowych (genotypowanie SNP)
  • rozwiązywanie problemów technicznych związanych z analizą wyników i obsługą sprzętu
  • w trakcie warsztatów będzie też możliwość konsultacji własnych wyników uczestników kursu z doświadczonymi użytkownikami różnych platform sprzętowych, praktykami w dziedzinie technik biologii molekularnej)

 

Zajęcia praktyczne oparte będą o następujące reakcje, znajdujące zastosowanie w molekularnej diagnostyce medycznej:

  • ilościowe oznaczanie poziomu ekspresji genu badanego i referencyjnego z użyciem sond hydrolizujących w układzie multiplex Dual-Color
  • genotypowanie pojedynczo-nukleotydowych polimorfizmów (SNP) za pomocą krzywych topnienia wysokiej rozdzielczości (High Resolution Melting, HRM)
  • genotypowanie polimorfizmów SNP za pomocą sond hybrydyzujących (Melting Curve Genotyping) lub allelo-specyficznych sond hydrolizujących (Endpoint Genotyping)

 

PROGRAM

DZIEŃ 1 | 25 stycznia 2010 Technika Real-time PCR - Oznaczenia ilościowe
9.55 Rozpoczęcie warsztatów 5 min
10.00 Wykład:
Podstawy techniki Real-time PCR
  • podstawy techniki Real-time PCR
  • formaty detekcji (sondy, barwniki, fluorochromy)
  • nomenklatura związana z techniką Real-time PCR (Ct, Cp, ΔΔCt, krzywa standardowa, wydajność reakcji)
60 min
11.00 Projektowanie eksperymentu
  • dobór materiału badawczego
  • przygotowanie prób (izolacja kwasów nukleinowych, warunki RT PCR)
  • zastosowanie Real-Time do oznaczania ilościowego kwasów nukleinowych – kwantyfikacja względna i bezwzględna
60 min
12.00 Przerwa na kawę 15 min
12.15 Projektowanie eksperymentu - c.d.
  • projektowanie starterów i sond – dostępne oprogramowanie komercyjne i darmowe, jak i ile zamawiać, przechowywanie, przygotowanie roztworów roboczych
  • dobór genów referencyjnych – standaryzacja wyników
  • eksperymenty typu dose-course i time-course
60 min
13.15 Przerwa na obiad 60 min
14.15 Przygotowanie do eksperymentu 15 min
14.30 Część praktyczna – oznaczenie względne (relative quantification) – reakcja multiplex w formacie Dual-color z kompensacją kolorów
W trakcie reakcji:
  • Universal Probe Library (UPL)
  • Panele Real-Time Ready
105 min
16.15 Interpretacja wyników 15 min
16.30 Sesja troubleshooting w oznaczeniach ilościowych 30 min
17.00 Zakończenie dnia
DZIEŃ 2 | 26 stycznia 2010 Real-Time w oznaczeniach jakościowych – genotypowanie
9.00 Wprowadzenie do genotypowania
  • SNP, mutacje i ich znaczenie
  • genotypowanie techniką real-time PCR jako alternatywa dla RFLP i SSCP
30 min
9.30 Projektowanie eksperymentu
  • formaty detekcji stosowane w analizie jakościowej
  • projektowanie sond HybProbe i Simple Probe – LightCycler Probe Design Software
  • gene scanning – High Resolution Melting (HRM)
  • genotypowanie typu end-point – sondy hydrolizujące
75 min
10.45 Przerwa na kawę 15 min
11.00 Przygotowanie do eksperymentu 15 min
11.15 Część praktyczna – genotypowanie metodą HRM
W trakcie reakcji – oznaczenie statusu metylacji z zastosowaniem metody HRM
105 min
13.00 Interpretacja wyników 15 min
13.15 Przerwa na lunch 60 min
14.15 Przygotowanie do reakcji genotypowania za pomoca sond (HybProbe /Taqman)
W trakcie reakcji – troubleshooting w reakcjach jakościowych
75 min
15.30 Interpretacja wyników 30 min
16.00 Zakończenie
Planowane szkolenia Planowane szkolenia
Archiwum Archiwum
Wyszukaj spotkanie edukacyjne dla...
Program Program



 
strona główna strona główna e-mail | kontakt | polityka prywatności do góry do góry