|
Szanowni Państwo, Serdecznie zapraszamy do udziału w warsztatach, których celem jest przedstawienie możliwości oraz zastosowania metod mikromacierzowych. Mikromacierze CGH stosowane są obecnie do identyfikacji niezrównoważenia genomu u pacjentów z niepełnosprawnością intelektualną, autyzmem, cechami dysmorfii lub wadami wrodzonymi, a także w diagnostyce onkologicznej. Dzięki nim diagnozujemy wiele defektów genomu nierozpoznawanych stosowanymi dotychczas metodami. Zaprezentujemy zasady działania metod mikromacierzowych oraz umożliwimy Państwu własnoręczne wykonanie dwóch platform obecnych na naszym rynku. Podzielimy się naszym doświadczeniem w stosowaniu mikromacierzy w rutynowej diagnostyce klinicznej oraz w realizacji projektów naukowych. Omówimy zasady i problemy interpretacji wyników badań uzyskiwanych tymi metodami, jak również przedstawimy technikę FISH, jako metodę z wyboru stosowaną do weryfikacji wyników uzyskanych metodą aCGH. Mamy nadzieję, że warsztaty nie tylko przybliżą Państwu tą najnowszą metodę analizy genomu, ale również ułatwią podjęcie decyzji odnośnie ewentualnego wyboru i kupna platformy, która spełni Państwa oczekiwania i będzie odpowiednia dla Państwa zamierzeń naukowych.
Prowadzenie warsztatów
dr Beata Nowakowska, Magdalena Nawara, Instytut Matki i Dziecka, Zakład Genetyki Medycznej, Pracownia Cytogenetyki Molekularnej
PROGRAM
|
DZIEŃ 1 | 11 stycznia 2010
|
|
10.20
|
Rozpoczęcie warsztatów
|
10 min
|
|
10.30
|
Wykład: Podstawy techniki mikromacierzy
- Mikromacierze firmy PrekinElmer
- Mikromacierze firmy Roche NimbleGen
|
40 min
|
|
11.10
|
Przedstawienie planu zajęć praktycznych (przekazanie protokołów i omówienie ćwiczeń)
|
30 min
|
|
11.40
|
Praca w grupach: Ćwiczenia praktyczne – przygotowanie i znakowanie DNA genomowowego do hybrydyzacji do mikromacierzy BACowych oraz oligonukleotydowych.
|
120 min
|
|
13.40
|
Wykład: Metody weryfikacji wyników otrzymanych metodą aCGH
- Technika FISH
- Technika MLPA
- Technika PCR i qPCR
|
60 min
|
|
14.40
|
Przerwa na obiad
|
30 min
|
|
15.10
|
Praca w grupach: Ćwiczenia praktyczne – przygotowanie mikromacierzy BACowych oraz oligonukleotydowych. Nastawianie hybrydyzacji.
|
120 min
|
|
17.10
|
Zakończenie dnia
|
|
|
DZIEŃ 2 | 12 stycznia 2010
|
|
8.55
|
Rozpoczęcie warsztatów
|
5 min
|
|
9.00
|
Praca w grupach: Ćwiczenia praktyczne – odpłukiwanie i skanowanie mikromacierzy oligonukleotydowych.
|
120 min
|
|
11.00
|
Praca w grupach: Ćwiczenia praktyczne – odpłukiwanie i skanowanie mikromacierzy BACowych.
|
120 min
|
|
13.00
|
Przerwa na kawę
|
30 min
|
|
13.30
|
Praca w grupach:
- Zapoznanie się z programami do analizy mikromacierzy.
- Analiza i omówienie wyników uzyskanych metodami aCGH (w grupach).
|
60 min
|
|
14.30
|
Dyskusja:
Rozwiązywanie problemów interpretacji i opracowania wyników
- zapoznanie się z internetowymi bazami danych
- przygotowanie wyniku analizy
|
60 min
|
|
15.30
|
Przerwa na obiad
|
30 min
|
|
16.00
|
Sesja "TROUBLESHOOTING", czyli wspólne rozwiązywanie problemów technicznych
- omówienie typowych problemów
- omówienie przypadków przedstawionych przez uczestników spotkania
|
30 min
|
|
16.30
|
Zakończenie warsztatów
|
|
|