|
Szanowni Państwo, Serdecznie zapraszamy do udziału w warsztatach, których celem jest przedstawienie możliwości oraz zastosowania metod mikromacierzowych. Mikromacierze CGH stosowane są obecnie do identyfikacji niezrównoważenia genomu u pacjentów z niepełnosprawnością intelektualną, autyzmem, cechami dysmorfii lub wadami wrodzonymi, a także w diagnostyce onkologicznej. Dzięki nim diagnozujemy wiele defektów genomu nierozpoznawanych stosowanymi dotychczas metodami. Zaprezentujemy zasady działania metod mikromacierzowych oraz umożliwimy Państwu własnoręczne wykonanie dwóch platform obecnych na naszym rynku. Podzielimy się naszym doświadczeniem w stosowaniu mikromacierzy w rutynowej diagnostyce klinicznej oraz w realizacji projektów naukowych. Omówimy zasady i problemy interpretacji wyników badań uzyskiwanych tymi metodami, jak również przedstawimy technikę FISH, jako metodę z wyboru stosowaną do weryfikacji wyników uzyskanych metodą aCGH. Mamy nadzieję, że warsztaty nie tylko przybliżą Państwu tą najnowszą metodę analizy genomu, ale również ułatwią podjęcie decyzji odnośnie ewentualnego wyboru i kupna platformy, która spełni Państwa oczekiwania i będzie odpowiednia dla Państwa zamierzeń naukowych.
dr Beata Nowakowska dr Katarzyna Derwińska
Prowadzenie warsztatów
dr Beata Nowakowska, dr Katarzyna Derwińska, Instytut Matki i Dziecka, Zakład Genetyki Medycznej, Pracownia Cytogenetyki Molekularnej
PROGRAM
|
DZIEŃ 1 | 28 września 2009
|
|
9.50
|
Rozpoczęcie warsztatów
|
10 min
|
|
10.00
|
Wykład: Podstawy techniki mikromacierzy
|
30 min
|
|
10.30
|
Przedstawienie planu zajęć praktycznych (przekazanie protokołów i omówienie ćwiczeń)
|
15 min
|
|
10.45
|
- I grupa: Pełne protokoły na zestawach: mikromacierze BACowe
- II grupa: Pełne protokoły na zestawach: mikomacierze oligonukleotydowe
|
120 min
|
|
12.45
|
Przerwa kawowa
|
20 min
|
|
13.05
|
Wykład: Technika FISH jako metoda weryfikacji wyników otrzymanych metodą aCGH
|
30 min
|
|
14.35
|
Przygotowanie sond molekularnych do techniki FISH
- izolacja DNA bakteryjnego
- znakowanie metodą Nick translacji
- hybrydyzacja
|
45 min
|
|
15.20
|
Przerwa na obiad
|
30 min
|
|
15.50
|
- I grupa: Pełne protokoły na zestawach: mikromacierze oligonukleotydowe
- II grupa: Pełne protokoły na zestawach: mikomacierze BACowe
|
120 min
|
|
17.50
|
Wykład: Analiza danych
|
45 min
|
|
18.35
|
Zakończenie dnia
|
|
|
DZIEŃ 2 | 29 września 2009
|
|
8.55
|
Rozpoczęcie warsztatów
|
5 min
|
|
9.00
|
- I grupa: odpłukiwanie i skanowanie mikromacierzy BACowych
- II grupa: odpłukiwanie i skanowanie mikromacierzy oligonukleotydowych
|
120 min
|
|
11.00
|
- I grupa: odpłukiwanie i skanowanie mikromacierzy oligonukleotydowych
- II grupa: odpłukiwanie i skanowanie mikromacierzy BACowych
|
120 min
|
|
13.00
|
Przerwa na obiad
|
30 min
|
|
13.30
|
Analiza wyników techniką FISH
|
30 min
|
|
14.00
|
Wykład: Praktyczne rady dotyczące zakupu i eksploatacji urządzeń do technik mikromacierzy
|
30 min
|
|
14.30
|
Zapoznanie się z programami do analizy mikromacierzy.
Analiza i omówienie wyników uzyskanych metodami aCGH (w grupach)
|
30 min
|
|
15.00
|
Wykład i dyskusja:
Rozwiązywanie problemów interpretacji i opracowania wyników
- zapoznanie się z internetowymi bazami danych
- przygotowanie wyniku analizy
|
30 min
|
|
15.30
|
Przerwa na kawę
|
20 min
|
|
15.50
|
Sesja "TROUBLESHOOTING", czyli wspólne rozwiązywanie problemów technicznych
- omówienie typowych problemów
- omówienie przypadków przedstawionych przez uczestników spotkania
|
40 min
|
|
16.30
|
Zakończenie warsztatów
|
|
|